马来西亚亚太科技大学的本科学制因专业不同而有所差异。一般来说,大多数本科专业的学制为三到四年。具体来说,科技类专业如计算机科学、软件工程等,以及商科类专业如商业管理、会计金融等,其学制多为三年。而工程类专业如电子工程等,学制则通常为四年。